吉大一院 图书馆始建于 1953年，馆舍面积600平方米。馆藏中外图书5万多册；中文期刊210种； 英文期刊120种 ；日文期刊30种。书刊的采购工作侧重于临床医学，语种主要为中文与英文。
　　图书馆现有 6名工作人员（3人为副研究馆员、1人为馆员、2人为助理馆员）。主要由书刊阅览室、文献检索室和书库三部分构成。
　　书刊阅览室有3名工作人员，主要负责中外图书与书刊的编目和登记、参考咨询、读者借阅等工作。日平均接待读者40-50人次。
　　文献检索室有3名工作人员。1人负责吉大一院网站的日常维护与信息更新；2人负责中文、英文文献的检索与统计学及临床流行病学咨询等工作。日平均接待用户50-60人次。
　　图书馆现有计算机 35 台，可供检索的中文、外文数据库有：
　　 　　中文数据库——
　　　 中国生物医学文摘数据库光盘版（ CBMdisc——1980年～2003年）
　　　 中国医院知识仓库 CHKD期刊全文库（1994年～）　
　　　 中国医院博硕士论文全文库（ 1994年～）
　　　 万方数字化期刊全文数据库等；（ 1997年～）
　　外文数据库 ——
外文期刊整合系统
　　 　PubMed
　 　　Elsevier Science,
　　　 Springer LINK
　　　 Kluwer Online
　　　 Ovid
　　　 Web of Science 等。